Noticias sobre Filogenética

Estudios de posgrado en Sistemática, INECOL, México

2008-10-07T10:01:00.007-05:00

CONVOCATORIA 2009
ASPIRANTES A ESTUDIOS DE MAESTRÍA O DOCTORADO EN CIENCIAS

El Instituto de Ecología A.C. (INECOL), convoca a todos los profesionistas interesados en biodiversidad y sistemática a cursar la Maestría o el Doctorado en Ciencias. Estos programas están dirigidos principalmente a los egresados de Biología, Agronomía, Química, Ecología, Veterinaria y otras carreras afines, aunque cualquier profesionista titulado puede concursar para lograr su ingreso.

El plan de estudios enfatiza la asesoría en el trabajo de tesis, con un mayor seguimiento y control del avance de cada estudiante. Los estudiantes deberán obtener su grado en un tiempo de 2 años en el caso de la maestría y de 4 años en el caso del doctorado.

La Maestría en Ciencias se enfoca a la investigación y a la práctica profesional, mientras que el Doctorado en Ciencias esta orientado a la investigación.

La Maestría y el Doctorado en Ciencias pertenecen al Programa Nacional de Posgrados (PNPC) lo que facilita que los estudiantes mexicanos y extranjeros puedan obtener una beca del CONACYT.

Más información sobre la investigación en Biodiversidad y Sistemática en el INECOL aquí>>

Más información sobre la Convocatoria aquí>>

Program for the 27 Hennig meeting, Tucuman

2008-10-01T20:11:00.003-05:00

We now have a semi-final program!
http://www.hennig27.com.ar/AbstractsHennig27.pdf

Cheers!

XXVII International Meeting of the Willi Hennig Society

2008-09-18T10:02:00.002-05:00

The meeting is getting closer!

Some people asked about flights to Tucumán… and yes, it is a pain in the neck, as we the locals verify every time we have to attend a meeting anywhere else. This time it's your turn! One of the good offers to fly to Tucumán is with a new company, Andes Líneas Aereas, whose web page is at www.andesonline.com.

We still don't have the final program (the deadline for reception of abstracts was extended, at the request of many people, and we are still receiving abstracts), but we do know some details…

The meeting will be starting in the morning of the 28th, at the Hotel Sol (http://www.hotelsolsanjavier.com.ar). All the talks, and the banquet (night of the 30th) will be held at the Hotel Sol. The Hotel Sol is up in the hill, west of the city of San Miguel de Tucumán. We will try to be at the airport for incoming flights, but just in case you're on your own, you can tell the taxi driver to go to the "Hotel Sol, Cerro San Javier". See map below.

The only other venue is going to be the Instituto Lillo (adress: Miguel Lillo 205, it's near the "Abasto" –the neighborhood is known by that name because the "Abasto" market used to be there). We will have a reception there the day before the meeting (as usual for Hennig meetings), that is, the evening of the 27th, and begin with registrations. At the Instituto Lillo, registration will start from 5pm, the reception will start after 6:30pm, of Monday October 27th.

If you have not yet registered for the Hotel, you should. The hotel is a lovely place, and it is not expensive. It is not very big, so we may run out of rooms. They have been holding some rooms for us, but they won't hold them for much longer. Don't risk missing it! If no more rooms are available when you try to book, and you have to get a room down town (and the "down" here is quite literal), we will be providing transportation to the Hotel everyday, with a bus which will fit about 40 people. Otherwise, you can just take a taxi (from the center, it's about 20 dollars, so that splitting among three people should be rather cheap).

VI Congreso Latinoamericano de Micologia

2008-09-10T10:16:00.004-05:00

Noviembre 10-13 2008
Mar del Plata, Argentina

VIII Reunión Latinoamericana de Scarabeidología

2008-09-10T10:12:00.003-05:00

INSTITUTO DE ECOLOGÍA, A.C.
XALAPA, VERACRUZ, MEXICO

OCTUBRE 13-17, 2009

El Instituto de Ecología, A.C. (INECOL), convoca a los interesados en participar en la VIII Reunión Latinoamericana de Escarabeidología (RELAS),

que se llevará a cabo en Xalapa, Veracruz, MEXICO, del 13 al 17 de octubre del 2009

COMITÉ ORGANIZADOR

Dr. Aristeo Cuauhtémoc Deloya López (cuauhtemoc.deloya@inecol.edu.mx)

Dr. Pedro Reyes-Castillo (pedro.reyes@inecol.edu.mx)

Dr. Mario Enrique Favila Castillo (mario.favila@inecol.edu.mx)

más información aquí >>>

Posición Postdoctoral en Genómica comparativa

2008-09-03T19:11:00.003-05:00

El Laboratorio de Bacteriologia Molecular, Departamento de Ingeniería Genética, Cinvestav Unidad Irapuato (Dr. Gabriela Olmedo Alvarez) en colaboración con el Laboratorio de Evolución Molecular y Experimental, Instituto de Ecología UNAM (Dra. Valeria Souza) invita a científicos que hayan recibido recientemente el grado de Doctor en Ciencias para que se integren al Cinvestav Unidad Irapuato para realizar una estancia postdoctoral por 12 meses, con posibilidades de extenderse por un periodo más.

Proyecto: Genómica comparativa de aislados bacterianos de Cuatro Cienegas, Coahuila.

Requisitos: Formación en Biología Molecular, habilidad computacional (UNIX, MySQL, PERL) con interes de aprender métodos de anotación y comparación de genomas.

Dedicación de tiempo completo a la investigación.

Solicitudes: Los candidatos interesados deben enviar su CV a: golmedo@ira.cinvestav.mx, con atención a la Dra. Gabriela Olmedo

Para su financiamiento la solicitud postdoctoral será preparada en conjunto con el aspirante y será presentada en la próxima convocatoria del CONACyT (Estancias Posdoctorales Vinculadas al Fortalecimiento de la Calidad del Posgrado Nacional)

Gabriela Olmedo

Depto. de Ingeniería Genética

AP 629 Irapuato, Gto. 36500

Tel. (462) 6239663 golmedo@ira.cinvestav.mx

IV International Rubiaceae (Gentianales) Conference

2008-09-01T12:02:00.002-05:00

October 19-24, 2008. Jalapa, Veracruz, Mexico.

The "Instituto de Biologia, UNAM" and the "Instituto de Ecologia, A.C." are pleased to announce that the fourth Rubiaceae Conference will be held in the Clavijero Botanical Garden of the Institute of Ecology in Jalapa, Veracruz, Mexico. This meeting will include papers and posters on the taxonomy, phylogeny and classification, morphology and anatomy, floristics, ecology and biogeography within Rubiaceae or other Gentianales. We particularly encourage students to submit the results of their work.

Deadline for abstracts: July 31, 2008.
Please visit www.ibiologia.unam.mx/rubiaceas/index.htm
For further questions, contact ivrubiaceae@ibiologia.unam.mx

Resultados de la encuesta: que programa usa?

2008-09-01T10:27:00.004-05:00

Aquí están los resultados de las preferencias sobre el uso de programas para la reconstrucción filogenética.
El programa favorito es PAUP, seguido de TNT y WinClada.

Durante Junio, Julio y Agosto participaron 53 votantes.
Muchas gracias por su participación.
Que otra encuesta sugieren?

Conferencia Internacional de Biogeografia en Mexico

2008-08-27T13:03:00.003-05:00

The Fourth Biennial Conference of the International Biogeography Society

The meeting will take place January 8-12, 2009 in Mérida, México.

Invited symposia will feature talks on the biogeography of disease, patterns and processes in biotic interchanges, disjunct distributions in Asia and America, and the biogeography of species extinction.

Attendees are invited to submit abstracts for oral and poster presentations. The conference will also include workshops, field excursions, and social events.

Registration, contact, and additional information may be found at: http://www.biogeography.org.

Cambio climático y Sistemática

2008-08-26T12:56:00.003-05:00

Climate Change and Systematics

3 day meeting
1st to 3rd of September 2008

A meeting organised by the Department of Botany, School of Natural Sciences, Trinity College Dublin, Ireland

This meeting, organised on behalf of the Systematics Association and the Linnean Society, will provide a forum for systematists to present and discuss their research as it relates to the critical issue of Global Climate Change. The conference is open to everyone, whatever their chosen discipline within systematics.

This meeting will examine the problems posed by Global Climate Change and will centre on three themes: 1. Climate change and speciation/extinction; 2. Climate change and biogeography; 3. Climate change: documenting and conserving biodiversity.

We feel this meeting is timely because of interest in this topic at all levels in society, especially governmental. For example, the Millennium Ecosystem Assessment states that 'By the end of the twenty-first century, climate change and its impacts may be the dominant direct driver of biodiversity loss and changes in ecosystem services globally' and 'Historically, habitat and land use change have had the biggest impact on biodiversity across biomes. Climate change is projected to increasingly affect all aspects of biodiversity, from individual organisms, through populations and species, to ecosystem composition and function'. The most recent IPCC report this year also highlights these issues. Therefore, global climate change needs to be addressed holistically by the systematics community.

Certainly the changes in the density and location of the World's biodiversity are likely to have impacts on speciation/extinction rates and on the ability of systematits to delimit, through Monographs, Faunas and Floras, the World's biodiversity.

Additional Information

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Más allá de la Cladística

2008-08-26T12:47:00.005-05:00

Beyond Cladistics: A Festschrift for Prof C J Humphries FLS

*Sandra Knapp FLS and David Williams FLS

Three-day Meeting
1st to 3rd of October 2008, 9:00 AM

As an approach to the discovery of phylogenetic relationships among organisms, cladistics took the systematics community by storm. According to David Hull, in his 1988 account of its history, cladistics was winning out everywhere; according to Colin Patterson, cladistics “began in the late 1960s, accelerated in the 1970s, and was virtually complete by the eighties”; in contrast, Gareth Nelson suggested that cladistics is suffering from “Arrested Development”. This symposium, entitled Beyond Cladistics, in honour of botanist Chris Humphries, will address some general issues relating to cladistics: its past, its present and its future – if, indeed, there is anything beyond cladistics itself.

Additional Information

Programme (pdf)
Registration Form (pdf)

Posiciones disponibles para taxonomos en el IISE

2008-08-25T12:30:00.008-05:00

CYBERTAXONOMY AND SPECIES EXPLORATION
The International Institute for Species Exploration (IISE) at Arizona State University invites applications for two unique tenured/tenure-track faculty positions at the intersection of life sciences and informatics. The IISE is dedicated to modernizing and advancing descriptive taxonomy and its collection and cyber infrastructures. We seek individuals with unusual vision to serve as ASU professors and as assistant directors of the institute. Positions are open rank, salaries commensurate with experience. Each position involves the use of effective leadership skills and a desire and capacity to work as part of a trans-disciplinary problem-solving team. The IISE, with partner museums and botanical gardens, is committed to identifying and removing obstacles to rapid progress in taxonomy. The successful candidates will join the director and existing assistant directors as the IISE leadership team. Each position includes 30% administration in IISE managing projects and partnerships, 30% teaching in the tenure home unit, and 40% research in area of expertise, related broadly to Institute goals.
Assistant Director for Monography and Inventories. The successful candidate must have an earned doctorate in systematic biology and demonstrated experience with descriptive taxonomy in a terrestrial or freshwater arthropod taxon. As assistant director, the successful candidate will coordinate interdisciplinary teams and advance projects with partner museums that include building international taxon knowledge communities, producing online monographic treatments, and undertaking large scale species inventories as well as work with IISE team to identify and remove impediments to taxonomy. Tenure home will be in School of Life Sciences.
Assistant Director for Taxonomic Cyberinfrastructure. The successful candidate must have an earned doctorate in computer science/engineering and demonstrated technical leadership for a domain specific cyberinfrastructure for taxonomy that will create and apply a new generation of tools, techniques and research environments that accelerate species exploration in all its phases. The successful candidate will both engage in projects with interdisciplinary teams of faculty, students, and partner institutions to conceive, engineer and prototype new digital tools and software as well as liaise with the Fulton School of Engineering faculty and external partners to recruit expertise appropriate to solve particular problems. Tenure home will be in the School of Computing and Informatics within the Fulton School of Engineering.

Please send CV, brief statement of interest, and names and e-mail addresses of four references to: Dr. Quentin Wheeler, Director, IISE c/o Ms. Shannon Keen at shannon.keen@asu.edu. Documents must be submitted in either Microsoft Word or PDF format. Review of applications will begin October 15, 2008, and continue until the search is closed. Nominations are welcomed. A background check is required for employment. Arizona State University is an affirmative action, equal opportunity employer committed to excellence through diversity.

Congreso internacional ICSEB en México

2008-08-25T10:30:00.006-05:00

VII International Congress of Systematic and Evolutionary Biology ICSEB

The International Organization of Systematic and Evolutionary Biology (IOSEB) extends an invitation to attend the VII International Congress of Systematic and Evolutionary Biology, under the themes “Celebrating the 200th anniversary of Darwin’s birth” and “Observing 150 years since the passing of Alexander von Humboldt”.

The congress will take place in Veracruz, Mexico on 6–10 July 2009. The program will consist of plenary lectures, symposia, and contributed papers and posters. Excursions to biologically interesting locations will also be available.

The focus of this congress, in context of significant historical backdrop, is on modern and forward-looking ideas, concepts, and methods in systematic and evolutionary biology. Due to its location, a strong emphasis will also be placed on understanding biodiversity in Latin America.

Confirmed plenary speakers and tentative titles include:

Dan Brooks, Toronto, Canada, Comparative Phylogenetic Biology
Michael Donoghue, New Haven, Connecticut, U.S.A., Biodiversity
Niles Eldredge, New York, U.S.A., Hierachical Theory of Evolution
Harry Greene, Ithaca, New York, U.S.A., Importance of Natural History in the 21st Century
Michael Hammond, Tucson, Arizona, U.S.A., Evolution and the Social Sciences
Tod Stuessy, Vienna, Austria, A Future for Systematic and Evolutionary Biology
Eors Szathmary, Budapest, Hungary, Nervous System Evolution
Christer Wiklund, Stockholm, Sweden, Experimental Studies of Evolutionary Mechanisms
Ed Wiley, Kansas, U.S.A., The Phylogenetic Revolution

For more information, see the ICSEB VII website or contact icseb.evol@univie.ac.at

Financiamiento para proyectos en sistemática vegetal

2008-08-25T10:25:00.002-05:00

IAPT Research Grants in Plant Systematics 2009
The IAPT announces a competitive grants program in plant systematics, with emphasis on funding students and young investigators in developing countries, but open to applicants world-wide. The program is based on the submission of research projects, taking into consideration the following guidelines:

1. The grant application period is open until 31 December 2008.
2. The award should be preferably used for supporting field work, travel to institutions, or laboratory investigations.
3. General information should be always included on the front page (complete name of the applicant, country, institution, project title, academic degree, telephone, fax and e-mail).
4. The projects should include brief ideas of an introduction, materials, methods, objectives, literature citation and other relevant information, especially noting if any other financial support for the project exists.
5. The length of the proposals should not exceed three pages.
6. In the case of Ph.D. students, in addition to the proposal, two recommendation letters should be included.
7. The projects are to be submitted to:
Patricia Dávila-Aranda, preferably by e-mail (pdavilaa@servidor.unam.mx)
or by regular mail: Facultad de Estudios Superiores, Iztacala, UNAM, Av. de los Barrios no. 1, Los Reyes Iztacala, Tlalnepantla. Edo. de México 54090. México
8. Applicants will be informed by e-mail of receipt of their proposals.
9. The total amount to be awarded is: US$10,000.
10. The maximum individual award is US$1,000.
11. The awarded projects will be announced on the IAPT web page and by e-mail to all the applicants on March 1, 2009.

Filogenia, Alometría y Evolución de las especies de Puya subgénero Puya (Bromeliaceae).

2008-08-13T13:45:00.002-05:00

Hornung-Leoni, C. 2005. Filogenia, Alometria y Evolución de las especies de Puya subgénero Puya (Bromeliaceae). Tesis de Doctorado. Instituto de Ecología AC. Xalapa, México.

Aunque la familia Bromeliaceae ha mostrado ser monofilética, existen conflictos en la ubicación de algunos géneros, como Puya Molina, que muestra distribución principalmente en los andes suramericanos y agrupa alrededor de 195 especies. El género ha sido dividido taxonómicamente en dos subgéneros, Puyopsis (187 spp) y Puya (8 spp). En este trabajo se realizón un análisis filogenético con base en caracteres morfológicos, para determinar si el subgénero Puya es un grupo monofilético y para explorar si el carácter que define al subgénero, ápice estéril de las ramas de la inflorescencia, es una sinapomorfía para el grupo. Los resultados muestran que si es un grupo natural y está soportado por varias sinapomorfías dentro de las cuales está el carácter diagnóstico del subgénero.

Otro aspecto interesante en Puya es la diferencia en tamaño, dado que las plantas varían desde 1 hasta 10 m de altura. En este estudio se realizó un análisis alométrico para determinar si existe un efecto de tamaño y forma como patrón de respuesta que explique dichas diferencias. Se estudiaron especies representativas del género Puya para determinar su hay relaciones alométricas entre las partes vegetativas y florales, y si existe correlación entre el tamaño y diversos factores como polinización, elevación y latitud, que expliquen las diferencias en tamaño. Se consideraron las variables altura de la planta, longitud de la hoja e inflorescencia, así como la longitud de los sépalos y pétalos, y se incluyó el tipo de polinizador (en los casos en que es conocido) para realizar análisis univariados y multivariados. Los resultados muestran que los caracteres estudiados están correlacionados con un componente de tamaño. A su vez se encontró que existe alometría, positiva para la longitud de los sépalos y pétalos, y negativa para longitud de la hoja. El tamaño de la inflorescencia es un carácter isométrico. No se encontró correlación entre el tamaño de la planta con la elevación y latitud. El único carácter correlacionado con tipo de polinizador resultó ser la longitud de los pétalos. En Puya se encontraron varios patrones alométricos. Plantas pequeñas con flores pequeñas están correlacionadas con una polinización por insectos, mientras que plantas medianas-grandes con aves y murciélagos.

Puya raimondii es la especie más grande de toda la familia, y ha sido poco estudiada debido a su floración prolongada y su condición monocárpica. En este trabajo se cuantificó y se identificaron los componentes químicos del néctar así como se observaron los visitantes florales que van en busca de este rico recurso ofrecido en dos localidades de la Puna peruana. Uno de los principales visitantes florales es el colibrí gigante, Patagona giga, a su vez se encontraron otros colibríes de menor tamaño. El néctar está compuesto por glucosa, fructosa, sucrosa, manosa, xilosa y derivados de la xilosa. También se encontró el aminoácido alanina. El néctar de Puya raimondii es producido en gran cantidad, suficiente para sostener un grupo de aves. La predominancia de esta especie en la puna y su gran producción de néctar hace de Puya raimondii un oasis de néctar.

Libro de Filogenetica desde Argentina

2008-08-08T11:33:00.006-05:00

Encontre la siguiente informacion de este libro en:
http://www.fcnym.unlp.edu.ar/catedras/taxonomia/material.html

ANALÍA A. LANTERI Y MARÍA MARTA CIGLIANO. (eds) 2004. Sistemática Biológica: fundamentos teóricos y ejercitaciones. EDULP. Argentina.

"Sistemática Biológica: fundamentos teóricos y ejercitaciones es un libro de texto organizado en 14 capítulos, cada uno de los cuales incluye una parte teórica y una serie de ejercicios prácticos. Los temas tratados comprenden aspectos clásicos de la práctica taxonómica, como la elaboración de claves dicotómicas, la organización de descripciones y la aplicación de los principios de la Nomenclatura Biológica. Se tratan también aspectos teórico-metodológicos relativos al análisis de datos moleculares, la aplicación de técnicas multivariadas para la delimitación de especies, el análisis cladístico y las aplicaciónes de la Cladística en otras ramas de la Biología Comparada. Las ejercitaciones están basadas principalmente en ejemplos de trabajos científicos realizados por las autoras de la obra, las cuales se desempeñan como docentes en la Cátedra de Introducción a la Taxonomía de la Facultad de Ciencias Naturales y Museo, de la UNLP. El texto está orientado a los alumnos que cursan dicha materia, pero puede ser de utilidad para estudiantes y profesionales que deseen iniciarse en la práctica de la Sistemática moderna."

Nuevamente, la pregunta es, ¿como podemos obtener un ejemplar de este libro?
Si alguien en Argentina puede ayudar para comprar y enviar el libro a México, lo agradeceremos varios por aca!

Analisis Filogenetico de 5 Familias de Micromurcielagos en la Cuenca del Lago de Cuitzeo Michoacan Mexico

2008-08-04T14:50:00.004-05:00

HERNANDEZ JIMENEZ, ARMANDO. 2008. Analisis Filogenetico de 5 Familias de Micromurcielagos en la Cuenca del Lago de Cuitzeo Michoacan Mexico. Tesis de Licenciatura, Centro Multidiciplinario de estudios en Biotecnologia, Universidad Michoacana de San Nicolas De Hidalgo. Morelia, Michoacan Mexico. 68 pp., ripsus@hotmail.com

Los quirópteros forman, después de los roedores, el segundo orden mas grande de los mamiferos, este orden incluye casi un cuarto de la diversidad de todos los mamiferos conocidos actualmente (916 especies). A pesar de la importancia de estos, sus relaciones evolutivas han permanecido escasamente estudiadas. Se analizo ADN con Marcadores Inter Simple Sequence Repeat (ISSR) para determinar las relaciones filogeneticas y de similitud entre 45 individuos capturados, de 15 especies pertenecientes a 5 familias: Molossidae, Vespertilionidae, Phylostomidae, Mormooptidae y Natalidae; Esta determinacion se baso en 172 loci obtenidos con 6 oligonucleotidos diseñados de forma aleatoria. Los dendogramas obtenidos por diferentes metodos mostraron una topologia poco consistente definida por clados debilmente soportados mostrando un alto grado de parafilia, concluyendo en la presencia de homoplasia demostrada por los valores de indice de consistencia (0.1652) e indice de homoplasia (0.8348) sugiriendo que el orden quiroptera representa un grupo complejo con muchos retos en cuanto a filogenia que requiere investigacion adicional.
Quiropteros ISSR Filogenia Sistematica Cordados 2008-06-26 13:57:25

Evaluacion de algunas regiones del ADNmt para analizar relaciones filogeneticas y variabilidad genetica en Cynomys mexicanus y Spermophilus spilosoma

2008-08-04T14:46:00.002-05:00

Guevara-Chumacero, Luis Manuel. 2004. Evaluacion de algunas regiones del ADNmt para analizar relaciones filogeneticas y variabilidad genetica en Cynomys mexicanus y Spermophilus spilosoma (Rodentia: Sciuridae), Tesis de Maestria en Biolog1a, Division de Ciencias Biologicas y de la Salud, UAM Iztapalapa. Mexico D.F. e-mail: lmgc1@yahoo.com
Sistematica Resto de Animales 2008-04-29 01:57:15

¿Desaparece siempre el ancestro?

2008-07-20T08:17:00.001-05:00

De acuerdo al principio de dicotomía utilizado para elaboración de los cladogramas, el ancestro solo puede dar lugar a dos descendientes en cada nodo de manera que la lectura de la topologia representada nos induce a pensar que este ancestro nunca sobrevive. ¿Refleja esto siempre la realidad? ¿El ancestro siempre desaparece? ¿No niega esto tanto la especiacion alopatrida como la simpatrida?

Software y algoritmos. Realidad, Cuasi-Realidad o Subjetividad

2008-07-04T12:18:00.003-05:00

Actualmente muchos investigadores se dedican a buscar "mejores" metodos y disenan software con el proposito de "optimizar" los resultados de las relaciones filogeneticas que se derivan de una matriz de estados de caracteres.

Mi duda es: Cual es la referencia corroborativa que se tienen en cuenta para afirmar que un algoritmo o un software determinado representa mejor que otro las verdaderas relaciones filogeneticas (relaciones naturales producto de su evolucion) existentes entre los miembro del grupo objeto de estudio (grupo interno). Dicho de otro modo, estamos tratando de explicar relaciones naturales (reales pero desconocidas por supuesto pues es lo que estamos tratando de explicar) a traves de algoritmos matematicos que han sido creados. Como tener un referente a partir de estos elementos para decir que una topologia A (hipotesis A) a la cual hemos llegado a traves de el software 1 con el grupo externo C, representa mejor la evolucion del grupo interno X que otra topologia B (hipotesis B) a la cual se llega a traves del software 2 con el grupo externo D. Siendo por supuesto la topologia A y B diferentes incluso si el grupo externo es igual para ambos procesos y solo cambian el software utilizado.

No existe en esto una dosis mas o menos alta de subjetividad?

Invitación: Tesis en Filogenética

2008-07-02T12:42:00.005-05:00

Se invita a todos, profesores, investigadores y estudiantes a anunciar aquí su trabajo de tesis a todos los niveles con temas afines a la filogenética (sistemática, biogeografía, ecología evolutiva, etc). Podrán incluirse en este registro las Tesis de cualquier nivel (Licenciatura o pre-grado. Maestría y Doctorado) que se relacionen con cualquier aspecto de la filogenética (en su sentido más amplio).
Dos opciones para publicar los resumenes.
Una es usar el formulario aqui. Su resumen es enviado y el Editor en unos dias lo pone en linea en este blog.

Otra opción si Ud ya esta registrado como colaborador en este blog es publicar directamente una "nueva entrada". Para ello, sugiero que en el campo del titulo de la "entrada" escriban
El titulo completo de la tesis (en el idioma original).

y en el campo de contenido, las primeras lineas de texto pueden escribir la referencia bibliográfica completa de la tesis.
En un párrafo nuevo inserten el resumen.
Cualquier otro dato, palabras clave, comentarios, gráficas, esquemas o fotografías pueden agregarse al final.
La etiqueta sugerida es: Tesis en Filogenética. Desde luego que pueden usar adicionalmente otras etiquetas.

Anteriormente, se había iniciado la compilación de Tesis en Filogenética y se publicaron unas cuantos resúmenes en la pag web: http://www.filogenetica.org/TesisEnFilogenetica.htm.
Esas tesis las he transferido aqui al blog y pueden considerarse como ejemplos para los formatos deseables. El sistema anterior de publicación dependía de enviar el texto por correo electrónico y después lo ponía en linea. Ahora con el blog, el colaborador podrá publicar y editar directamente su texto y gráficos en linea!

Que les parece? Ojala en el transcurso de las siguientes semanas veamos sus colaboraciones. Profesores, pidan a sus estudiantes que den a conocer sus tesis!
Saludos!

Sistemática molecular de especies del género Astragalus (Fabaceae) distribuidas en el centro de México

2008-07-02T12:36:00.000-05:00

Salgado Hernández, Esmeralda. 2006.. Sistemática molecular de especies del género Astragalus (Fabaceae) distribuidas en el centro de México . Tesis de grado Licenciatura, Universidad Autonóma del estado de Hidalgo.Pachuca Hgo. México.

Resumen: Se investigó la posición filogenética de diez de las 12 especies del género Astragalus (Fabaceae) reportadas para el centro de México, mediante un análisis cladístico de secuencias de la región del espaciador interno transcrito (ITS) del DNA ribosomal del núcleo. Seis de las especies recolectadas pertenecen a la sección Strigulosi y las cuatro especies restantes pertenecen a otras secciones del género. Las secuencias de las especies del centro de México fueron analizadas junto con otras disponibles en el GenBank. Los resultados obtenidos indican que las especies del centro de México (n = 11 y 15) son miembros del clado de "Neo-Astragalus", en donde se encuentran todas las especies aneuploides con distribución en Norteamérica y Sudamérica. El clado de Neo-Astragalus presentó tres clados resueltos en el consenso estricto y el resto de las especies fueron politómicas. Las seis especies de la sección Strigulosi con distribución en el centro de México se encontraron en uno de los tres clados resueltos en Neo-Astragalus junto con ocho especies de Sudamérica, una especie de la sección Quinqueflori (A. aff. quinqueflorus), una especie de la sección Hypoleuci (A. hypoleucus) y dos especies de la sección Leptocarpi (A. arizonicus, A. nothoxys). Dos especies (A. cobrensis y A. rusbyi) de la sección Strigulosi, cuya secuencia se obtuvo del GenBank, se encontraron fuera del clado en el que están todas las especies de la sección con distribución en el centro de México. Las especies A. wootonii y A. mollissimus recolectadas en el centro de México se incluyeron en el segundo clado resuelto en Neo-Astragalus. La posición filogenética de estas especies fue apoyada por un carácter morfológico del fruto. También se delimitó a las especies A. strigulosus, A. guatemalensis. A. lyonnetii, A. micranthus, A. hypoleucus y A. mollissimus, para esto se consideró el concepto filogenético de especie y la formación de grupos monofiléticos, parafiléticos y polifiléticos..

Palabras clave: Astragalus, nrDNA ITS, Neo-Astragalus, Filogenia, especie.

Disciplina: Sistemática,

Grupo Taxonómico: Angiospermas

Filogenia del género Pachycereus (Pachycereeae, Cactaceae)

2008-07-02T12:35:00.000-05:00

Arias Montes, Angel Salvador. 2002. Filogenia del género Pachycereus (Pachycereeae, Cactaceae). Tesis de Doctorado, Instituto de Recursos Naturales, Colegio de Postgraduados. Montecillo, Texcoco. México. 185 pp.

Resumen: Se desarrolló una hipótesis filogenética para el género Pachycereus (A. Berger) Britton & Rose con el propósito de fundamentar la monofilia del género, basada en la clasificación más reciente que propone 12 especies más una descrita recientemente. 30 taxa se\r\nanalizaron mediante el método de la cladística Y bajo el criterio de parsimonia. Las fuentes de información filogenética utilizadas fueron la morfología Y las secuencias génicas. Los caracteres morfológicos empleados fueron del tallo, flor, fruto y semilla, así como anatomía del tallo. Caracteres de la madera y la semilla se exploraron con particular interés, encontrando pocos caracteres filogenéticamente informativos. Se evaluaron 42 caracteres morfológicos en total. Fueron analizadas tres secuencias génicas, de las cuales dos son genes del cloroplasto (intron trnL y espaciador trnL-F, intron rpl16) y una es nuclear (ITS). Los resultados usando las dos fuentes por separado y combinadas (evidencia total) indicaron que: (a) la subtribu Pachycereinae sólo puede ser monofilética si se incluyen dos especies de Stenocereus: S. aragonii y S. eichlamii; (b) el género Pachycereus no es monofilético de acuerdo con la clasificación más reciente; (c) Pachycereus hollianus y P. lepidanthus forman un grupo basal en la subtribu Pachycereinae y no pertenecen al género Pachycereus; (d) Pachycereus fulviceps está relacionada con los géneros Cephalocereus y Neobuxbaumia y no con otros miembros del género Pachycereus; (e) se define un clado con 13 especies al que se le llamo informalmente grupo Pachycereus. En este grupo se resuelve un clado con cinco especies (P. grandis, P. pecten-aboriginum, P. pring/ei, P. tepamo y P. weben), que se define como monofilético con dos sinapomorfias morfológicas: un surco interareolar y la forma de la flor tipo G. Este grupo de cinco especies integran el género Pachycereus y se sugiere que Carnegiea es su género hermano. Pachycereus gatesii, P. schottii y P. marginatus se definen en un clado bien apoyado al cual se le llama género ophocereus. Stenocereus aragonii y S. eich/amii forman un clado al cual se le aplica el nombre genérico de Marshallocereus. Pachycereus gaumeri y P. mi/itaris son divergentes dentro del grupo y con las evidencias presentadas se considera apropiado restablecer los\r\ngéneros Pterocereus y Backebergia. Se presenta un tratamiento taxonómico para el género Pachycereus, redefiniendo el número de especies con base en el análisis filogenético, una clave de identificación y las descripciones para cada especie. Se señalan las especies a excluir del género Pachycereus.

Palabras clave: anatomia, semillas, cladistica, taxonomia.

Disciplina: Sistemática.

Grupo taxonómico: Angiospermas.

RELACIONES FILOGENTICAS EN PSOROPHORA ROBINEAU-DESVOIDY (DIPTERA: CULICIDAE) POR MEDIO DE METODOS CLADISTICOS

2008-07-02T12:34:00.000-05:00

LIRIA SALAZAR, JONATHAN. 2002. RELACIONES FILOGENTICAS EN PSOROPHORA ROBINEAU-DESVOIDY (DIPTERA: CULICIDAE) POR MEDIO DE METODOS CLADISTICOS. Trabajo Especial de Grado (Maestría). Postgrado en Entomología, Facultad de Agronomia. Universidad Central de Venezuela. Maracay-Estado Aragua, VENEZUELA. 113p.

Resumen: Se determinaron las relaciones filogenéticas en el género Psorophora con base al análisis cladístico de 66 caracteres morfologícos (L4, pupas, machos y hembras) en 29 especies de las 45 reportadas en este taxón. El grupo interno utilizado incluye tres subgéneros: Cinco de Psorophora, siete de Grabhamia, y doce de Janthinosoma. Como grupos externos y hermanos se utilizaron dos géneros de Culicini (Culex y Toxorhynchites) y dos géneros de Aedini (Aedes y Haemagogus), y un Mansoniini (Mansonia), respectivamente. En el análisis parsimonioso se utilizó NONA/WINCLADA obteniéndose 11 árboles de 164 pasos de longitud (IC=0,66 e IR=0,83). La hipótesis muestra a Aedini (Haemagogus, Aedes y Psorophora) como grupo monofilético incluyendo a Mansonia titillans (Mansoniini), sugiriendo la inclusión de este taxón en Aedini como grupo natural. La monofilia del género Psorophora es soportada por tres sinapomorfías: Larva con peine del segmento VIII en forma de tridente, hembra con tergo y externo VIII con estructuras tipo barra, y genitales masculinos con pocos dientes en el proceso del esternito X. Los clados de los subgéneros Psorophora, Grabhamia, y Janthinosoma fueron soportados por cuatro, tres y dos sinapomorfías respectivamente, validando la clasificación subgenérica. Sin embargo en Grabhamia y Janthinosoma se apreciaron politomías internas, por lo cual las relaciones evolutivas no fueron explicadas.

Abstract: Phylogenetic relationships in the genus Psorophora were examined based on a cladistic analysis of 66 morphological characters (fourth instar larvae, pupae, males and females) of 29 species available from the 45 species reported in the genus, representing the three subgenera. The ingroup species were: five Psorophora (10 spp total, 50%), seven Grabhamia (15 spp total, 47%) and twelve Janthinosoma (20 spp total, 60%). Two Culicini genera (Culex and Toxorhynchites), two Aedini genera (Aedes and Haemagogus), and one Mansoniini (Mansonia) were used as outgroups and sister groups respectively. A parsimony analysis using NONA/WINCLADA resulted in 11 trees, each with 164 steps (CI = 0.66 and RI = 0.83). The analysis indicated that Aedini (Haemagogus, Aedes and Psorophora), is monophyletic group that includes Mansonia titillans (Mansoniini), suggesting natural inclusion of the Mansoniini tribe with Aedini. The genus Psorophora is monophyletic, supported by 3 synapomorphies: larvae with presence of trident-like scales in segment VIII; female with tergo and sternum VIII with rod-like structure and male genitalia with few teeth on the sternite process on segment X. The current subgeneric classification was validated by our results. The clades representing the subgenera Psorophora, Grabhamia and Janthinosoma were supported by four, three and two synapomorphies respectively. However, within Grabhamia and Janthinosoma, internal polytomies were observed leaving the internal evolutionary relationships unresolved.

Palabras clave: Aedini, cladistica, mosquitos, Mansoniini, morfología.

Disciplina: Sistemática.

Grupo taxonómico: Insectos Culicidae.

Bases metodológicas del uso de Grupo Externo en los análisis cladísticos

2008-07-02T12:33:00.000-05:00

Keller Pérez, Roberto Andrés. 1998. Bases metodológicas del uso de Grupo Externo en los análisis cladísticos. Tesis de Licenciatura, Facultad de Ciencias, UNAM. México DF. México. 81 pp.

El objetivo de este trabajo es muy concreto: entender las bases metodológicas del MGE bajo los estándares de la teoría cladista actual. Los capítulos primero y segundo tratan principalmente la parte teórica y operacional del método. En el primer capítulo se describe la manera en que opera el MGE y se discute las suposiciones de trabajo, las condiciones que el método requiere y sus resultados. En el segundo capítulo se explora la relación que el MGE tiene con el criterio de parsimonia, como concepto fundamental en la reconstrucción filogenética. Cada capítulo presenta una discusión alrededor de una idea particular y, por lo tanto, existe como una pieza independiente con su introducción, desarrollo, conclusiones y bibliografía. No obstante, todos los capítulos están unidos bajo los temas de la polaridad y el MGE. El orden que guardan estos dos capítulos es irrelevante para su lectura, aunque ambos se apoyan mutuamente uno en el otro. Sin embargo, el tercer capítulo no puede leerse de la misma forma que los dos anteriores. En este capítulo, a diferencia de los otros, no se realiza un análisis profundo de una idea, sino que se hace una revisión general de los métodos para polarizar caracteres.